A Watch Dogs által festett jövőben bekövetkezett, amitől sokan rettegtek - az emberek élete szinte teljes mértékben az elektronikus kütyük tömegétől vált függővé, és mindenki a mobiltelefonján őrzi élete legféltettebb titkait, melyek ezáltal a központi operációs rendszer (ctOS) részévé is válnak. A játék hőse, Aiden Pearce pedig félelmetes hatalom birtokába kerül: képes hozzáférni a központi adatbázisban tárolt minden egyes adathoz.
Aiden élete persze nem egyszerűen SMS-ek kikémleléséről szól; mobiljával bankszámlákat törhet fel, elektromos készülékeket hackelhet meg, metrószerelvényeket állíthat le és még megannyi ehhez hasonló "szuperképességgel" próbálja meg szebbé varázsolni Chicago mindennapjait. Nem lesz könnyű dolga, ugyanis a rendőrség mellett a hozzá hasonló hackerek csoportja is rá vadászik...
