A Watch Dogs folytatásában Marcus Holloway bőrébe bújva San Francisco hatalmas városában kalandozhatunk majd, amely a ctOS 2.0-nak köszönhetően teljes megfigyelés alatt áll, ezáltal minden autót, robotot, drónt, de még a legutolsó informatikai hálózatot és jelzőlámpát is a rendszer irányít, miközben a lakosság egyaránt teljes megfigyelés alatt éli életét.
Miután hősünket a ctOS 2.0 tévesen vádolja meg egy olyan dologgal, amit el sem követett, Marcus üldözötté válik a saját városában, ám néhány barátja oldalán mindezt nem hagyja szó nélkül, így fegyvert ragadva, főként hacker-képességeire és futurisztikus eszközeire alapozva ott rúg bele a rendszerbe, ahol a legjobban fáj neki.
